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透明细胞肾细胞癌预后lncRNA研究:尊龙凯时引领创新与深度!

发布时间:2025-07-30   信息来源:尊龙凯时官方编辑

尊龙凯时发布了一项有关透明细胞肾细胞癌(ccRCC)研究的新成果,题目为《一种新的干性相关lncRNA特征可预测透明细胞肾细胞癌的预后、免疫浸润和药物敏感性》。该研究探讨了干性在ccRCC中的作用,并确定了一组新的长非编码RNA(lncRNA)特征,以改善患者的预后预测及个性化治疗。

透明细胞肾细胞癌预后lncRNA研究:尊龙凯时引领创新与深度!

研究背景

透明细胞肾细胞癌是泌尿生殖系统中最为常见的恶性肿瘤,其具有高度的异质性。研究表明,肿瘤的干性与其进展、复发及转移密切相关,然而,干性对ccRCC预后的具体影响仍不明确。同时,lncRNA在调控基因表达及肿瘤增殖与凋亡等过程中的作用也备受关注,但其在ccRCC中的具体作用仍需深入研究。

研究方法

本研究旨在系统分析ccRCC中的干性相关lncRNA,构建可用于风险分层和预后预测的特征集。研究者利用TCGA和GEO数据库获取基因表达及临床数据,计算样本的RNA干性得分(RNAss)。通过加权相关网络分析(WGCNA),识别出与RNAss相关性的lncRNA和mRNA,并进行功能富集分析。随后,研究者应用多种机器学习算法构建预后特征模型,并在TCGA-KIRC和GSE29609队列中进行验证,分析预后、免疫浸润、药物敏感性等方面的差异。

研究结果

通过WGCNA,研究者在TCGA-KIRC队列中构建了共表达网络,并识别出452个干性相关lncRNA。此外,基于差异表达基因的基因本体论(GO)分析发现,这些基因主要参与神经发生及细胞分化等生物学过程。结合KEGG通路分析,研究揭示了多条癌症相关信号通路的显著富集现象。

预后模型建立

经过101种算法组合及交叉验证,研究最终确定LASSO回归结合逐步Cox回归为最佳模型,纳入了10个SRlncRNA,构建出较为准确的预后特征。通过多变量Cox回归,确认了6个核心SRlncRNA作为风险因子,确立了高风险组患者预后显著更差的规律。

免疫浸润与药物敏感性分析

研究还通过免疫浸润分析发现,高风险组患者的免疫细胞浸润水平更高,在药物敏感性分析中,低风险组对特定药物的敏感性显著提升。此外,整合多个数据库,研究筛选出了7种潜在药物,为个性化治疗提供了新的选择。

突变分析与预测模型构建

在突变分析中,高、低风险组均发现了VHL等高频突变基因,且高风险组的肿瘤突变负荷显著升高。进一步选择完整人口学和预后记录的样本,构建了预测模型,通过引入多种临床因素,显著提高了OS预测的准确性。

结论

本研究首次建立了ccRCC专属的干性相关lncRNA特征集,为癌症的预后、免疫浸润及药物敏感性提供了新见解。核心lncRNA如EMX2OS和LINC00944通过调控细胞增殖、迁移等生物过程,可能成为ccRCC精准治疗的新靶点。未来,尊龙凯时将持续致力于生物医学研究,通过精准的生信分析和个性化的实验方案,推动科学研究与临床应用的发展。